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열에서 일치하는 부분 문자열을 기준으로 데이터 프레임 행 선택

telebox 2023. 6. 6. 08:11
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열에서 일치하는 부분 문자열을 기준으로 데이터 프레임 행 선택

열에 있는 문자열의 부분 일치를 기준으로 데이터 프레임에서 행을 선택하려고 합니다(예: 열 'x'에 문자열 "hsa"가 포함됨).사용.sqldf만약 그것이like구문 - 다음과 같은 작업을 수행합니다.

select * from <> where x like 'hsa'.

불행하게도,sqldf이 구문을 지원하지 않습니다.

또는 유사하게:

selectedRows <- df[ , df$x %like% "hsa-"]

물론 효과가 없는 것입니다.

누가 이것 좀 도와주시겠어요?

당신이 어떤 기능을 언급한 것을 알아챘습니다.%like%당신의 현재 접근 방식에서.저는 그게 그 사건에 대한 언급인지 모르겠어요.%like%"data.table"에서 사용할 수 있지만, 만약 그렇다면 다음과 같이 사용할 수 있습니다.

개체가 다음과 같을 필요는 없습니다.data.table(그러나 부분 집합화 접근 방식은data.frame모래땅data.tables가 동일하지 않음):

library(data.table)
mtcars[rownames(mtcars) %like% "Merc", ]
iris[iris$Species %like% "osa", ]

데이터의 부분 집합을 설정하기 위해 행 위치와 열 위치를 혼합했을 수 있습니다.


패키지를 로드하지 않으려면 다음을 사용해 보십시오.grep()일치하는 문자열을 검색합니다.다음은 예입니다.mtcars데이터 집합. 여기서 행 이름에 "Merc"가 포함된 모든 행을 일치시킵니다.

mtcars[grep("Merc", rownames(mtcars)), ]
             mpg cyl  disp  hp drat   wt qsec vs am gear carb
# Merc 240D   24.4   4 146.7  62 3.69 3.19 20.0  1  0    4    2
# Merc 230    22.8   4 140.8  95 3.92 3.15 22.9  1  0    4    2
# Merc 280    19.2   6 167.6 123 3.92 3.44 18.3  1  0    4    4
# Merc 280C   17.8   6 167.6 123 3.92 3.44 18.9  1  0    4    4
# Merc 450SE  16.4   8 275.8 180 3.07 4.07 17.4  0  0    3    3
# Merc 450SL  17.3   8 275.8 180 3.07 3.73 17.6  0  0    3    3
# Merc 450SLC 15.2   8 275.8 180 3.07 3.78 18.0  0  0    3    3

그리고, 또 다른 예는,iris데이터 집합 문자열 검색osa:

irisSubset <- iris[grep("osa", iris$Species), ]
head(irisSubset)
#   Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
# 1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
# 2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
# 3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa
# 4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa
# 5          5.0         3.6          1.4         0.2  setosa
# 6          5.4         3.9          1.7         0.4  setosa

문제에 대해 시도해 보십시오.

selectedRows <- conservedData[grep("hsa-", conservedData$miRNA), ]

해라str_detect()문자열에 패턴이 있는지 여부를 탐지하는 stringr 패키지에서.

다음은 다음과 같은 접근 방식을 통합한 접근 방식입니다.%>%파이프와filter()dplyr 패키지에서:

library(stringr)
library(dplyr)

CO2 %>%
  filter(str_detect(Treatment, "non"))

   Plant        Type  Treatment conc uptake
1    Qn1      Quebec nonchilled   95   16.0
2    Qn1      Quebec nonchilled  175   30.4
3    Qn1      Quebec nonchilled  250   34.8
4    Qn1      Quebec nonchilled  350   37.2
5    Qn1      Quebec nonchilled  500   35.3
...

처리 변수에 "non" 부분 문자열이 포함된 행에 대한 샘플 CO2 데이터 세트(R과 함께 제공됨)를 필터링합니다.의 여부를 조정할 수 있습니다.str_detect고정 일치 항목을 찾거나 regex를 사용합니다. stringr 패키지에 대한 설명서를 참조하십시오.

LIKEsqlite에서 작동해야 합니다.

require(sqldf)
df <- data.frame(name = c('bob','robert','peter'),id=c(1,2,3))
sqldf("select * from df where name LIKE '%er%'")
    name id
1 robert  2
2  peter  3

다른 옵션은 단순히 사용하는 것입니다.grepl함수:

df[grepl('er', df$name), ]
CO2[grepl('non', CO2$Treatment), ]

df <- data.frame(name = c('bob','robert','peter'),
                 id = c(1,2,3)
                 )

# name id
# 2 robert  2
# 3  peter  3

언급URL : https://stackoverflow.com/questions/13043928/selecting-data-frame-rows-based-on-partial-string-match-in-a-column

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